Как и говорилось ранее, события в фильме происходят примерно через неделю, после возвращения Атлантиды в Млечный путь, на Землю. Атлантида была отослана на обратную сторону Луны, подальше от любопытствующих глаз. Команда продолжала активно работать, операции не прекращались, как это было и в Пегасе. До тех пор, пока МакКей внезапно не сделал открытие, что Атлантида саморазрушится, если срочно не вернется в галактику Пегас.

Тут же все члены экспедиции вызываются обратно на Атлантиду, для возвращения назад в Пегас: Тейла, Келлер, Бекетт, Лорн, Зеленка, Шеппард и Ронон. Как только все собираются, МакКей информирует их, что они должны возвратить Атлантиду в Пегас как можно быстрей. Это значит, что они должны будут использовать червоточный двигатель. Зеленка делает расчеты, которые показывают, что этот вариант возможен, но понадобится сделать два прыжка.

Атлантида отправляется в свой путь. Первый же прыжок заканчивается плачевно, двигатель сгорел и восстановлению не подлежит. Часы тикают. Однако, сканирование пространства выявило что по близости находится планета, пригодная для жизни. Они отправляются туда в поисках помощи, но вместо неё попадают в совершенно невероятное приключение, связанное с путешествием во времени, где Тодд, рейф, одновременно становится их самой опасной угрозой и самым близким союзником.

И это все, что хотел рассказать Маллоцци про написанный им с Полом сценарий. Он все ещё надеется, что сценарий не останется пылиться на полке и его реализуют может быть в виде комикса, романа или радиопьесы.