Дэниел тоже работает на этой заставе, и как раз в это время он обнаруживает, что адрес Затерянного города состоит из 8 символов, т.е. Атлантида находится не в нашей галактике. Джексон определяет, что адрес ведет в галактику Пегаса. О'Нилл направляется в гущу событий на вертолете, за штурвалом которого - майор Джон Шеппард, служащий на одной из близлежащих американских баз, и ничего не знающий о заставе, вратах и Древних. К этому моменту, МакКею удается уговорить Бекетта сесть в кресло. Когда Бекетт попытался сконцентрироваться в нем, неожиданно из арсенала базы показался самонаводящийся снаряд и отправился искать цель. А самой доступной целью оказался вертолет Джека. Шеппард начал удирать и уворачивать вертолет от снаряда, а Беккет в это время пытался расслабиться и нейтрализовать оружие - в последний момент ему это удалось.
Когда О'Нилл, наконец, добрался до базы, Вейр организовала брифинг, на котором Дэниел объяснил, что Древние покинули Землю (видимо, из-за чумы), улетев вместе со всем городом. Найти Антлантиду хотят все, но для этого нужен Модуль Нулевой Точки (тот генератор энергии, который SG-1 нашли в ep.721 - Lost City. Part 1 - я вот только одного не пойму, почему МНТ был на планете, покрытой лавой, но отсутствовал на базе в Антарктиде? уж не для того ли, чтобы растянуть эпизод Lost City на две серии?) - иначе энергии не хватит. Джек нехотя, но согласился на экспедицию.
А в это время Шеппард прогулялся по заставе, поболтал с Бекеттом, который выложил ему все о Звездных вратах и генах Древних, а потом устал и не нашел удобнее места для отдыха, кроме Кресла. Неожиданно Кресло активировалось. Прибежал весь командный состав, а МакКей начал не теряя времени изучать возможности Кресла и Шеппарда. Он попросил Джона представить Землю в Солнечной системе - мгновенно над его головой появилась голографическая карта...
Прощаясь с О'Ниллом:
Вейр: Он нужен нам там.
Джек: Извините, Дэниел нужен мне здесь.
Вейр: Вообще-то я про Шеппарда...
О'Нилл попытался объяснить Элизабет, что Джон не идеален, но Вейр попросила Джека посмотреть в зеркало. Но тут выяснилось, что Шеппард не горит желанием отправляться в другую галактику - правда, Джек быстро вставил ему мозги на место.
Итак, международная экспедиция (народу много, человек под 100, наверное) готова к отправке, но что они найдут в галактике Пегаса и смогут ли вернуться - никто не знает. Начались сцены прощаний. Элизабет разрешили рассказать жениху всю правду (хотя, по его лицу было не похоже, что он поверил), лейтенант Форд попрощался с бабушкой и дедушкой, Бекетта мама накормила обедом, МакКей поцеловал на прощание кошку (потом отдал ее девушке, но сама девушка поцелуя не удостоилась), а Шеппард просто посидел на берегу реки.
Перед открытием врат Шеппард успел сцепиться с полковником Самнером, старшим по званию военным в экспедиции (эту роль исполняет Роберт Патрик - экс-Терминатор, экс-агент Доггет):
Самнер: Не я вас сюда выбрал...
Шеппард: Я вам понравлюсь, когда вы узнаете меня поближе.
Самнер: А до тех пор помните, кто здесь приказывает.
Шеппард: Доктор Вейр, так ведь? (далее Флениган так играет мимикой, что можно просто умереть со смеху)
Стабильная червоточина установилась и экспедиция небольшими группами отправилась в путь. Дэниел в очередной раз жалобно поскулил, но Джек, так же в очередной раз, сказал твердое "нет".
По ту сторону врат обнаружился огромный город древних - Атлантида, он же - база Атлантис. Город, обнаружив присутствие человека, начал оживать от многотысячелетней консервации. Команды Самнера начали обследовать базу, обеспечивая безопасность. И тут выяснилось, что город находится под водой, а от затопления его спасает энергетический купол. А потом МакКей обнаружил голограмму. Девушка рассказала, что они прибыли в эту галактику, чтобы распространить в ней жизнь, но на одной из планет они разбудили ужасных созданий, которые питались людьми. Эти создания уничтожили все молодые миры, остался только Атлантис, но силы Древних слабели, они были вынуждены погрузить город под воду и уйти на свою родную планету (на Землю, похоже).
На этом сюрпризы не закончились: оказалось, что МНТ, питающие город, почти исчерпаны, поэтому купол начал слабеть и вот-вот город будет затоплен. Необходимо либо найти источник энергии, либо покинуть город - но для возвращения на Землю энергии тоже не хватает. А вот путешествия по галактике Пегаса вполне возможны - так и начали новоявленные Антланты исследовать базу данных Древних.
Первым же миром стала планета Атос. Оказалось, что ее население очень малочисленно и все они занимаются земледелием, охотой и торговлей с другими планетами. Лидер этого народа, Тейла Эммаган заявила, однако, что они не торгуют с незнакомцами. Шеппард сразу же предложил организовать знакомство.
Атозианцы очень удивились, что гости прибыли из города их предков. Они рассказали, что все планеты этой галактики терроризирует раса Рейфов, и если земляне не знают кто это, лучше бы им быстро улететь домой.
Тейла повела Шеппарда к развалинам древнего города атозианцев. По пути Шеппард нашел медальон Тейлы, который она потеряла еще в детстве (запомните, это нам понадобится через пару серий!), а потом они достигли древних наскальных рисунков о нашествиях Рейфов, которые случаются с некоторой периодичностью. (Тут Тейла заметила, что последний Холокост был несколько поколений назад - неплохо отсталая инопланетянка осведомлена о земной истории!)
И тут группа военных, дежурившая у врат, неожиданно зафиксировала их активацию. Когда червоточина открылась, из нее появились небольшие летательные аппараты, направившиеся к деревне. Тейла, сопровождавшая Шеппарда на обратном пути к поселению, безошибочно узнала звуки нашествия Рейфов ...